协同创新的基本内涵是多资源整合，包括资源、知识、行为、绩效等的全面整合，多方组织、机构协调，主要有政府、企业、研究院所、中介机构、用户等。同时单一产业发展要与相关的产业进行交互，产业链的协同优化类似于一个开放的系统。由于其包含的内容广、组织结构复杂，进行产业链协同创新要考虑相互联系的多种要素，从系统全局性的角度出发，运用整体性逻辑全面覆盖相关各方，实现“1+1>2”的整体价值增值。

产业链本身是多个维度的有机整体，包括企业链、供需链、空间链、价值链四个维度。各个维度分别反映产业中不同方面的内容，企业链涵盖的是产业中各个部分相互链接的关系，描述企业外组织形式的特征。供需链以物质传输为基础，核心内容是生产环节的链接，由供应链、技术链、需求链、物流链等组成。空间链是产业在各区域经济内的结构特征，运用地区性逻辑对产业链进行划分。价值链反映的是技术产品价值转换的问题，对产业化及发展成熟有重大影响。因此，对产业链进行创新不仅仅是一个复杂系统整合规划的问题，同时也是多维度协同创新的问题。